土木工程处
土木工程处是土木工程拓展署七个分处之一，由土木工程处处长领导，其下设有海港及土地科，工程及环境管理科和房屋科，各由一名副处长领导。
海港及土地科由海港工程部，土地工程部及改善码头工程组组成，主要负责港口、海岸工程 及为土地拓展进行土地平整、因应房屋、灵灰安置所、火葬场发展项目和相关发展所需的工地平整及基础设施及填海工程的规划、可行性研究、设计及施工。工程及环境管理科由填料管理部，专责事务( 工程) 部及工程项目组组成，负责管理多种土木工程项目及专责策划、设计及兴建因应房屋和相关发展所需的工地平整及基础设施、旅游及康乐发展的辅助工程、海事工程、与公众填土、海上砂源及制订整体公众填土策略和计划 有关的土木工程，策划及运作趸船转运站和填料库。房屋科由房屋工程1组，房屋工程2部及房屋工程3部组成，负责推展公营房屋及相关发展项目的工程可行性研究、勘探、详细设计、工地平整及基础建设工程。
海港及土地科
土地工程部主要负责规划、设计及监督土地平整工程及相关基础建设，如，道路及排水系统妀善工程。该部亦负责制订和执行绿化总纲图计划。
改善码头工程组主要负责规划、设计及监督公众码头的改善工程。
重建桥咀码头
重建南丫岛北角码头(规划中) - 构思图
工程及环境管理科
填料管理部主要负责制订及管理本港整体公众填料策略，和海泥卸置及海洋填料资源策略，包括管理公众填料接收设施、建筑废物筛选分类设施及卸置海泥设施。该部由七个分组组成，每组由一名高级工程师领导。该部共有约120名工作人员，其中约20人为专业土木工程师。
填料管理部的主要工作范畴如下：
- 制订整体公众填料策略和计划，以及策划长期及短期的策略性公众填料接收设施及建筑废物筛选分类设施。
- 管理公众填料接收设施及建筑废物筛选分类设施，以及签发卸泥牌照和相关事宜。
- 确认及管理各公共工程、半官方机构及私人发展项目对海上砂源的供应及需求。
- 供应及管理海泥的卸置容量。
- 搬运沙粒许可证
- 建筑废物处置收费计划
专责事务(工程)部负责多种土木工程项目的整体行政、规划、设计、建造和工地监督， 包括公营房屋发展项目的工地平整和基础设施、旅游及康乐发展的辅助工程、以及改善避风塘设施的海事工程等。
本组负责规划及执行因应房屋和相关发展所需的工地平整及基础设施工程，包括道路、排水及排污、水务和环境美化等工程。
房屋科
本组负责规划及执行因应房屋和相关发展所需的工地平整及基础设施工程，包括道路、排水及排污、水务和环境美化等工程。